存储式厕所和公共厕所库储存粪便污泥是需要收集和处理的。因为没有处理所涉及的公共厕所。在前者的情况下，人类排泄物沉积在水桶和铲斗的内容每日被清空。在后者的排泄物被存储在一个库用于去除之前长达两个星期更长的时间。该库的内容最好用机械方法清除。

污泥的特性从产生的污泥在所发生细菌分解了一年多比较新鲜粪便材料有很大的不同。所需的处理，因此依赖于污泥的特性。前者可能含有大量的病原体，后者将包含多由于病原体模销少。污泥应该小心处理，避免接触病原体。污泥可以与重金属等污染源的污染物相互污染，特别是当工业废物被倒入到下水道。因此，工业废料处理前是不应该排放到下水道的。含有高浓度重金属或者有毒的化学物质的处理将更加困难，而且，这种情况的污泥再利用率的潜力也是有限的。

粪便污泥含有植物所必需的营养物质氮和磷，是潜在的有机肥料的植物。污泥中的有机碳，一旦稳定下来，是可以作为土壤调节剂来使用的，因为它改进的土壤结构对植物的根所能够提供养料的环境。

污泥基本处理过程包括稳定，增稠，脱水，干燥和焚烧。而最后一步是最为昂贵的，因为所需要的燃料和气体燃烧的空气污染控制要求需要很全面的过程和处理程序。没有被工业废料的重金属所污染的污泥是最好焚烧的。一些污泥的可利用转换过程已经被发现并且在生产制造过程中使用了，例如：从污泥产生油已经被开发出来，它可以是适合于重度污染的污泥 。处理污泥的成本一般都是相同的顺序从废水中除去的污泥的费用。

从堆积处所收集的粪便污泥具有极高的生化需氧量，所以其通常带着极具腐烂的恶臭味。从活性污泥处理厂的初级和次级淤泥还具有很高的BOD，这种物质的存在使得污泥可能难以脱水。即使污泥在沉积处已经经过沉淀并且有细菌分解过至少一年，其仍具有较高的BOD 。稳定是用来表示BOD减少的过程的术语。稳定处理可以有氧或厌氧条件下进行。

好氧稳定初级和次级的污泥，可以在曝气池中进行相同方式的活性污泥处理。在高氧需求下，这个过程所需的能量密集的并且成本很高。需氧稳定需要较少的能量，当进行与堆肥过程的一部分。对于污泥堆肥，其固体含量应提高到至少15％ ，这样它才可以被处理为固体。浓缩脱水一级和二级污泥须达到所要求的固体含量。污泥可能含有足够高燃烧固体，用干燥的材料如干燥木屑混合可有助于实现所要求的固体含量，以及实现所要求的碳氮比进行堆肥处理。