如上所述，生物的絮状物是活生物流入初级沉降槽（或澄清）流出物的营养物质组成的生态系统。这些大多是含碳固体被溶解或者受到曝气被分解的生物氧化转化为二氧化碳。同样的，含氮溶解固体（氨基酸，氨等）也被氧化为絮状物，其中以亚硝酸盐，硝酸盐为主，在一些工艺中，这些可以通过反硝化处理来实现。

脱硝的处理工艺是受到鼓励的，但是在脱硝后许多悬浮曝气装置将会损害絮状物的沉淀，这将会导致出水的水质变差，这点极大地影响了整个处理流程的进行和处理质量。

在这两种情况下，这两种混合的解决方法，既能够保证流入初级的流出物保证其继续处理，也可以转向 到固体脱水。有趣的是，被污染的活性污泥会呈现出诺卡形式的棕色泡沫，这个所谓的“污水木耳”最有名的是有很多不同的真菌和原生生物。此外，某些传入的化学物中，如重农药，重金属（例如电镀工厂流出的污水就会含有各类的重金属物质）负荷，或极端的PH值，可以杀死活性污泥反应器的生态系统的生物群。这些在处理过程中可以被预先捕获然后进行中和处理。